L'any 1743, l’enginyer Joris Prosper va fer un projecte d’ampliació del Port de Barcelona on, al final del braç de Ponent, va construir un primer far per dirigir l’entrada dels vaixells. El projecte d’aquest far va ser objecte de nombroses propostes- algunes d’elles força monumentals- i finalment es va construir en 1772 quan el moll de Ponent va estar finalitzat. A més a més del far, el moll acollia el despatx de passaports, el control sanitari, la comandància de marina i la caseta del pràctic.
A conseqüència de l’ampliació del Port, aquest va perdre la seva funció l’any 1904, ja que es va construir un nou far a la muntanya de Montjuïc, fins a tal punt que es volia enderrocar-lo per deixar lliure els molls i destinar-los a activitats comercials. Finalment, gràcies a alguns vocals, la Junta d’Obres del Port va decidir conservar el far pel seu valor històric i patrimonial i només es van destruir els edificis que el rodejaven. En 1912 es va substituir la llanterna del far per un gran rellotge de quatre esferes. El rellotge original el va muntar i mantenir el rellotger Josep Besses. Com a curiositat, aquest primer rellotge anava destinat al nou edifici de Comandància de Marina, però provisionalment el van instal·lar a la Torre on es va quedar. D'ençà que es va posar aquest rellotge, l’edifici no només va canviar la seva funció i aspecte físic, sinó que també se’l va conèixer popularment com a Torre del Rellotge i donava les hores als treballadors del Port i vianants. Amb el pas del temps s’ha convertit en un símbol per al barri de la Barceloneta i per a la ciutat. Estem parlant de l’edifici patrimonial més antic del Port de Barcelona.
Durant l’any 2022, es va celebrar el 250è aniversari de la Torre amb diferents activitats i actuacions, entre elles la restauració del segon mecanisme de la Torre del Rellotge fabricat per Manufacturas Blasco i que llueix al vestíbul de la Torre.
Amb la remodelació del Moll de Pescadors, la gent pot accedir i veure de prop aquesta singular torre.